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26-05-04 16:11
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그림 4. 발달 과정 중 FL에서 HEP, MSC 및 EC의 전사체 재구성
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유전자 발현 변화의 잠재적 영향을 더 자세히 조사하기 위해 RNA-seq 데이터로부터 세포 내 경로 활성을 추론할 수 있는 계산 도구인 PROGENy를 사용했습니다.42 각 세포 유형에 대해 E13.5와 E17.5 사이의 차등 발현 유전자(DEG)를 계산하고( log2 FC 의 절댓값 ≥ 1, 거짓 발견율[FDR] = 0.05), 14개의 서로 다른 경로에 대한 활성 점수를 계산했습니다. 담관세포 및 간세포 계열로의 간모세포 분화를 조절하는 데 있어 Wnt/β-카테닌 신호전달의 역할에 대한 기존 보고와 일치하게, 이 세포 유형에서 가장 높은 활성은 WNT 경로에서 관찰되었습니다( 그림 4D ). 이러한 좁은 전환기 동안, 전사체 변이는 MSC와 EC에서 종양 괴사 인자 α(TNF-α) 및 핵인자 κB(NF-κB) 경로를 포함한 염증 관련 신호 전달 경로와 세 가지 기질 세포 유형 모두에서 JAK-STAT 및 형질 전환 성장 인자 β(TGF-β) 경로에 집중적으로 나타났습니다( 그림 4D ~4F).